Anne florasının bebeğin bağışıklık sistemindeki önemi oldukça fazladır. Normal doğum ile dünyaya gelen bebekler, doğum kanalından geçerken annenin bağırsak florasını da ağız yoluyla alırlar. Bağırsak florasında bebeğin bağışıklık sistemini koruyup güçlendirmek için gerekli olan faydalı bakteriler bulunmaktadır. Dolayısıyla bebekler bu florayı aldıkları andan itibaren bağışıklık için dünyaya bir koruma kalkanı ile gelmektedirler. Bu faydalı bakteriler bebeklerin ileriki yaşlarında enfeksiyonlara, obeziteye ve kansere yakalanma risklerini de ciddi oranda azaltmaktadır. Sezaryen ile doğan bebeklerde ise flora geçişi olmaz ve bebek doğduktan sonra müdahaleler ile bağışıklık sistemi gelişmeye başlamaktadır.